La membresía no está compuesta necesariamente de biólogos y ecólogos, sino de profesionales y estudiantes de otros campos relacionados con temas de conservación. Actualmente la Sociedad cuenta con una membresía de más de 800 individuos e instituciones desde México hasta Panamá. También pueden ser miembros individuos o instituciones extranjeras vinculadas a la región
La SMBC, cuenta con dos órganos de gobierno: la Asamblea General, su máximo órgano (el conjunto de todos los miembros asociados) y la Junta Directiva elegida por la Asamblea General. La Junta Directiva está conformada por los siguientes cargos:
La SMBC se organiza por medio de sus capítulos nacionales autónomos. Los países miembros de la SMBC en este momento son:
Cada uno de ellos cuenta con una representación y una estructura mínima.
El Comité de Ética de la SMBC fue creado el 13 de noviembre 2008 durante la Asamblea General de la SMBC en San Salvador, El Salvador, y está integrado por los siguientes destacados miembros de la SMBC: